Die Academia de Ciencias de Cuba ist seit 1931 Mitglied.
Die ursprüngliche kubanische Akademie der Wissenschaften wurde am 19. Mai 1861 unter der spanischen Krone als Königliche Akademie der medizinischen, physikalischen und naturwissenschaftlichen Wissenschaften von Havanna gegründet. 1902 behielt die Akademie ihre Struktur und Organisation bei, strich jedoch das Wort „königlich“ aus ihrem Namen, da sie begann, in einem nationalen republikanischen Umfeld zu agieren. 1962 wurde eine Nationale Kommission für die Akademie der Wissenschaften von Kuba gegründet, die erstmals mit nationaler Reichweite ausgestattet war. 1980 wurde die Akademie in den Rang eines Ministeriums befördert, das zentral für alle wissenschaftlichen und technologischen Aktivitäten zuständig ist. 1994 fusionierte die Verwaltungsstruktur der Akademie mit der Nationalen Kommission für Umwelt und natürliche Ressourcen und dem Exekutivsekretariat für nukleare Angelegenheiten zum Ministerium für Wissenschaft, Technologie und Umwelt.
Im April 1996 wurde die Akademie der Wissenschaften Kubas (Academia de Ciencias de Cuba) per Gesetz in ihrer jetzigen Form als offizielle Institution des kubanischen Staates mit unabhängigem und beratendem Charakter in Wissenschaftsangelegenheiten gegründet.
Die Ziele der Akademie der Wissenschaften sind die Förderung der kubanischen Wissenschaft, die Verbreitung des nationalen und universellen wissenschaftlichen Fortschritts, die Anerkennung des Prestiges für herausragende wissenschaftliche Forschung, die Anhebung ethischer Berufsstandards und die soziale Anerkennung der Wissenschaft sowie die Stärkung der Verbindungen von Wissenschaftlern und ihre Organisationen, untereinander, mit der Gesellschaft insgesamt und mit dem Rest der Welt.
Die Akademie verfügt über ein professionelles Personal, das die Leitungsgremien bei der Erfüllung ihrer Aufgaben unterstützt. Die Akademiker gehören den Sektionen der Akademie an, die nach wissenschaftlichen Fachgruppen organisiert sind: Biomedizinische Wissenschaften, Agrar- und Fischereiwissenschaften, Technische Wissenschaften, Sozial- und Geisteswissenschaften sowie Natur- und Naturwissenschaften.